なんらかの問題があるのでしょうが、はっきり言ってわかりません。
iBookだけでは機種もわかりませんし、トラブルの細かい内容が
不明なので、何がどうと言える状態ではありません。
「自分なりにいろいろ試した」とありますが、その内容も
書いてもらわない事には全くこちらにはわかりません。
フリーズはともかく、OSが消滅なんてどうやってそうなったのか
説明が無い事には、トラブルなのか、あなたの操作の問題なのか
こちらからは推測する事も難しいです。

そうなった経緯、それに対してどう対処したのか、
「いろいろ」や「散々」では全くわかりません。
書くのが面倒臭いから端折っているのかどうかわかりませんが、
あなたの側が情報を提供してくれないと答えにくい事を理解してください。

HDがクラッシュしていれば、まず起動する事自体が困難になります。
OS XとOS9が同居していても何も問題はありません。
OSの相性の意味するところがわかりません。

結構深刻のようですから、CDから起動し、消去して、再インストールをした方がよいと思います。
（工場出荷状態に戻す）　その際、OS9も入れるための、チェックボックスもあるはずですから忘れずに。

…さん、明日から春さん　コメント有難うございます。
早速、OS 10.3.7よりOS 9.2.2に再起動し、しばらくデーター処理を
行いました所、OS 9.2.2がフリーズ。再起動を試みた所、？マーク。
　因に当方のシステム
　　iBook Power PC G3
366M・　M7716J/A
メモリ　193・
　　　HDD 80GB に変更
年末年始は普通に動いていたのですが、ここ最近は、インターネットに接続後
２〜３分後にインターネット接続が突然終了したり、アプリケーションの
突然終了。OSの再起動　OS 10.3.7よりOS 9.2.2　または、その逆を行うと
片側のOSが居なくなってる等の症状がでます。
やはり、このメモリでは容量不足なのでしょうか。
現在は、HDD　初期化の後、OS 9.2.2　を再インストールして使っています。